【佳學基因檢測】納米孔測序單細胞分析時代的表觀遺傳腫瘤異質性

國內(nèi)正規(guī)腫瘤基因檢測機構關鍵點

從不同的基因測序技術中如何選擇測序平臺，從而實現(xiàn)以幫助病人為目的的腫瘤基因檢測。這個問題的答案可以從《Sci Rep》在 2015; 5: 13201發(fā)表了一篇題目為《納米孔測序單細胞分析時代的表觀遺傳腫瘤異質性》腫瘤組織基因突變異質性的臨床研究文章。該研究由Lasse Vinner, Tobias Mourier, Jens Friis-Nielsen, Robert Gniadecki, Karen Dybkaer, Jacob Rosenberg, Jill Levin Langhoff, David Flores Santa Cruz, Jannik Fonager, Jose M. G. Izarzugaza, Ramneek Gupta, Thomas Sicheritz-Ponten, Søren Brunak, Eske Willerslev, Lars Peter Nielsen, and Anders Johannes Hansen等完成。揭示了在單細胞水平上腫瘤基因組織異質性、多樣性的情況，進一步充實了基于基于信息的靶向藥物選擇。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關鍵詞：

表觀遺傳學,納米孔測序,CpG 島,腫瘤異質性,甲基化胞嘧啶,牛津納米孔,MinION

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應用結果

納米孔測序將該技術帶到了測序科學的下一代。這是通過以下方面的研究來實現(xiàn)的：孔效率、創(chuàng)建控制 DNA 易位的機制、提高信噪比以及擴展到長讀取范圍。關于表觀遺傳學的異質性將是廣泛的，因為表觀基因組中的突變對在癌癥研究中引起新挑戰(zhàn)很敏感。催化 DNA 甲基化和組蛋白修飾的表觀遺傳酶在癌細胞中失調并導致許多異質克隆進化。在這些克隆中檢測這種異質性在治療各種癌癥類型中起著不可或缺的作用。通過單細胞分析，納米孔測序技術可以提供簡單的長讀序列，預計很快將在床邊或醫(yī)生辦公室使用。在這里，我們回顧了納米孔測序的進展及其在癌癥表觀遺傳異質性檢測中的應用。關鍵詞：表觀遺傳學，納米孔測序，CpG 島，腫瘤異質性，甲基化胞嘧啶，牛津納米孔，MinION

腫瘤發(fā)生與反復轉移國際數(shù)據(jù)庫描述：

Epigenetics, Nanopore sequencing, CpG island, Tumor heterogeneity, Methylated cytosine, Oxford nanopore, MinION