【佳學(xué)基因檢測】三陰性乳腺癌基因檢測正確治療進(jìn)展
乳腺癌基因檢測與正確治療導(dǎo)讀
《三陰性乳腺癌基因檢測對治療的幫助作用》對六種三陰性乳腺癌亞型進(jìn)行了PAM50亞型分析,并比較了它們的PAM50分子固有亞型。結(jié)果發(fā)現(xiàn),除LAR和MSL亞型外,所有三陰性乳腺癌亞型主要由基底樣亞型組成(BL1[99%]、BL2[95%]、IM[84%]和M[97%])。LAR亞型包括HER2(74%)和luminal B(14%);MSL亞型包括基底樣(50%)、正常樣(28%)和管腔B型(14%)?!度橄侔?a href='http://jinzhounet.cn/cp/zhongliu/' target='_blank'>腫瘤850正確用藥基因解碼》對不同三陰性乳腺癌亞型進(jìn)行了預(yù)后分析,發(fā)現(xiàn)LAR亞型具有較高的無遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移生存率和總生存率(OS),而M和BL2亞型的預(yù)后較差。M和BL2亞型的3年反復(fù)率明顯高于LAR亞型。此外,對130例接受蒽環(huán)類藥物和紫杉醇化療的三陰性乳腺癌患者的回顧性分析表明,盡管總體病理有效緩解(pCR)率為28%,但亞型之間的特異性反應(yīng)存在顯著差異。BL1亞型的病理有效緩解(pCR)率賊高(52%),而BL2、LAR和MSL亞型的病理有效緩解(pCR)率分別為0%、10%和23%。
作為上述分子亞型的補(bǔ)充,《乳腺癌的致病基因鑒定》分析了198例患者的樣本,并將三陰性乳腺癌分為四個亞型:LAR型,表達(dá)AR和細(xì)胞表面粘蛋白MUC1型;M型, 表達(dá)生長因子受體(血小板衍生生長因子受體α[PDGFRα]和c-Kit受體);BLIS(基底樣免疫抑制)型,表達(dá)免疫抑制分子VTCN1;BLIA(基底樣免疫激活)表達(dá)STAT信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子并釋放細(xì)胞因子。預(yù)后分析顯示,無病生存率(DFS)的順序為BLIA>M>LAR>BLIS(p = 疾病特異性生存率(DSS)為BLIA>M>LAR>BLIS(p = 0.07)。
腫瘤正確用藥基因解碼研究團(tuán)隊還在試圖進(jìn)一步明確三陰性乳腺癌分子亞型是否與不同種族和民族的臨床結(jié)果差異有關(guān)。迄今為止,基于對基因解碼接受程度的差異,與白人女性相比,非白人女性很少被納入到具有三陰性乳腺癌基因檢測分型的研究中,盡管西班牙裔和非裔美國女性在三陰性乳腺癌患者中所占比例都高于白人女性。即使在癌癥基因組圖譜(TCGA)中有1000多名女性患乳腺癌,也很少有樣本來自患有三陰性乳腺癌的非高加索女性。乳腺癌的分子分型研究使用nCounter基因表達(dá)編碼集,將48名西班牙裔、12名非裔美國人、21名亞裔和34名白種人的三陰性乳腺癌分為亞型:BLIA、BLIS、LAR和M。未發(fā)現(xiàn)家族史、種族和民族與四種亞型的總體分布之間存在關(guān)聯(lián)。在多變量Cox比例風(fēng)險模型中,西班牙裔女性在BLIS患者中所占比例顯著較高(53%,p = 而亞洲女性在BLIS患者中所占比例較低(19%,p = LAR患者比例較高(38%,p = 0.06)與所有組的平均比例相比。該研究中的亞洲女性代表的BLIS患者數(shù)量顯著減少,LAR患者數(shù)量顯著增加,并顯示出賊佳的OS,這與之前報道的生存率一致。
與大多數(shù)基因檢測不同的是,基因解碼技術(shù)做為技術(shù)核心的基因檢測項目同時考慮到長非編碼RNA(lncRNAs)在腫瘤細(xì)胞發(fā)生、惡化與轉(zhuǎn)移過程中的重要作用,整合信使RNA(mRNA)和lncRNA轉(zhuǎn)錄組圖譜的新分類將有助于更好地理解三陰性乳腺癌的異質(zhì)性,進(jìn)而使賦予基因解碼更為正確地個性化描述能力。在對165個三陰性乳腺癌樣本進(jìn)行分類分析,結(jié)合mRNA表達(dá)分析和共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析,以確定mRNA和lncRNAs之間的相互作用后,乳腺癌基因解碼研究人員提出并改善了三陰性乳腺癌的分類標(biāo)準(zhǔn)。免疫調(diào)節(jié)亞型(immunomodulatory subtype,IM)表達(dá)一種獨(dú)特的基因本體(Gene Ontology,GO)分類圖譜,并參與免疫細(xì)胞的調(diào)節(jié)。這些調(diào)節(jié)因子包括細(xì)胞因子信號(細(xì)胞因子和細(xì)胞因子受體之間的相互作用)、免疫細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(T細(xì)胞受體信號通路和B細(xì)胞受體信號通路)、抗原處理和呈遞、趨化因子信號通路和免疫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(NF-κB信號通路)。IM亞型中高表達(dá)的基因都與免疫功能有關(guān),如免疫反應(yīng)、T細(xì)胞共刺激和先天免疫反應(yīng)。一些參與免疫應(yīng)答過程的基因(CCR2、CXCL13、CXCL11、CD1C、CXCL10和CCL5)也高度表達(dá),表明IM亞型三陰性乳腺癌與免疫調(diào)節(jié)密切相關(guān)。LAR亞型具有獨(dú)特的激素調(diào)節(jié)途徑,包括雄激素和雌激素代謝、類固醇激素生物合成、卟啉和葉綠素代謝。過氧化物酶體增殖物激活受體(PPAR)信號通路在LAR亞型中也顯著增加。盡管免疫組化分析表明LAR亞型為ER陰性,但信號通路表達(dá)譜顯示雌激素信號通路的激活,表明LAR亞型可能對抗雄激素和傳統(tǒng)抗雌激素治療有反應(yīng)。間充質(zhì)樣亞型(ME)具有多種獨(dú)特的GO類成員和信號通路,如細(xì)胞外基質(zhì)-受體相互作用、縫隙連接、TGF-β信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路以及與生長因子相關(guān)的通路(ABC轉(zhuǎn)運(yùn)體和脂肪因子信號通路)。BLIS亞型:BLIS亞型中豐富的GO術(shù)語包括細(xì)胞分裂、細(xì)胞周期、DNA復(fù)制和DNA修復(fù)調(diào)節(jié)。在BLIS亞型中,增殖相關(guān)基因的表達(dá)顯著增強(qiáng),包括CENPF、BUB1和PRC1。因此,BLIS亞型具有高度增殖特性。BLIS亞型中涉及免疫應(yīng)答(免疫應(yīng)答和先天免疫應(yīng)答)、免疫細(xì)胞信號(T細(xì)胞共刺激、T細(xì)胞受體信號通路、B細(xì)胞活化和DC細(xì)胞趨化)和補(bǔ)體活化過程的基因顯著下調(diào)。預(yù)后分析顯示,與其他亞型相比,BLIS亞型患者的RFS更差,反復(fù)風(fēng)險更高。這些結(jié)果與Burstein等人之前的統(tǒng)計結(jié)果一致。
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